Может ли самозанятый вычесть расходы из доходов

Нет, вычитать расходы из доходов могут только лица, применяющие УСН.

Налогоплательщикам НПД придется заплатить 4% или 6% со всей суммы дохода. Вычитать расходы самозанятым нельзя.